机房空调间接自然冷却系统由室内机组，室外干冷器（或冷却塔）和水泵等组成。室内机组是在水冷型机组的蒸发盘管上面增加了一套自然冷却冷水盘管。

室外温度较高时，压缩机制冷运转，冷却水在板式换热器内吸热，通过干冷器，（或冷却塔）散热；

在室外温度相对低时，水温达到一定要求时，控制水阀，让部分或全部冷水流经自然冷却冷水盘管，冷却室内部分或全部负荷。

因为制冷剂循环独立于自然冷却水循环，所以该系统具有混合运行模式，即在使用自然冷却的同时，压缩机间歇性运行来保证制冷量的要求。这样一来提高了使用自然冷却的室外温度范围，产生更大的节能效果。其实物示意如下图所示：

其系统原理示意如下图所示：